Mustaqillik yillarida Qoraqalpogʻiston iqtisodiyoti sezilarli oʻzgarishlarga duch keldi. Qishloq xoʻjaligi va sanoat sektori rivojlandi, energiya, qurilish materiallari va oziq-ovqat sektorlari kengaydi. Tabiiy gaz qazib olish oʻsishi mintaqaning iqtisodiy bazasini mustahkamladi